El equipo Pagani creó el Zonda R con ingeniería de punta para lograr satisfacer las demandas de desempeño que requiere la versión para pista del popular Zonda F. El monocasco central, hecho de una aleación de carbono y titanio, incrementa la rigidez del coche y reduce su peso. Los componentes de la suspensión, así como las partes estructurales del motor y la caja de cambios, también se diseñaron para reducir el peso total del coche a tan solo 1.070kg con el tanque vacío. El motro Mercedes AMG V12 de 6.0 litros que está fijado directamente al chasis aporta 750hp y 710Nm de par motor.